Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1T6

Lrp3, Low density lipoprotein receptor-related protein 3, mousemouse

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Length 790 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp3E9Q1T6 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lrp3E9Q1T6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrp3E9Q1T6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrp3E9Q1T6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrp3E9Q1T6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrp3E9Q1T6 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
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Lrp3E9Q1T6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Lrp3E9Q1T6 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms