Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gm3095E9Q058 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Gm3095E9Q058 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms