Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fndc1E9Q043 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Fndc1E9Q043 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Fndc1E9Q043 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 109.7 ms