Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brd1E9PZ26 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Brd1E9PZ26 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms