Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Parp4E9PYK3 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Parp4E9PYK3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms