Protein–RNA interactions for Protein: E9PX29

Sptbn4, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,561 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn4E9PX29 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sptbn4E9PX29 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Sptbn4E9PX29 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms