Protein–RNA interactions for Protein: E9PWP9

4931408C20Rik, RIKEN cDNA 4931408C20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,381 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931408C20RikE9PWP9 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
4931408C20RikE9PWP9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
4931408C20RikE9PWP9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms