Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Vpreb3D3Z6J4 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms