Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5F7

Gm20521, Predicted gene 20521, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20521D3Z5F7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gm20521D3Z5F7 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gm20521D3Z5F7 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms