Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4S3

Ptrhd1, Putative peptidyl-tRNA hydrolase PTRHD1, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptrhd1D3Z4S3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ptrhd1D3Z4S3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ptrhd1D3Z4S3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms