Protein–RNA interactions for Protein: D3Z235

Gm3543, Predicted gene 3543, mousemouse

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Length 184 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3543D3Z235 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm3543D3Z235 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm3543D3Z235 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms