Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc8D3YZV8 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ccdc8D3YZV8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms