Protein–RNA interactions for Protein: D3YXE9

BC048679, cDNA sequence BC048679, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC048679D3YXE9 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
BC048679D3YXE9 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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BC048679D3YXE9 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
BC048679D3YXE9 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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