Protein–RNA interactions for Protein: D3YUR1

4930444P10Rik, RIKEN cDNA 4930444P10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930444P10RikD3YUR1 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
4930444P10RikD3YUR1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
4930444P10RikD3YUR1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms