Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Cspp1B2RX88 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Cspp1B2RX88 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.6 ms