Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Cfap58B2RW38 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cfap58B2RW38 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms