Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rd3lB2RV38 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rd3lB2RV38 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms