Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.58■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Abcc8B2RUS7 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Abcc8B2RUS7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Abcc8B2RUS7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms