Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Znf518aB2RRF6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Znf518aB2RRF6 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms