Protein–RNA interactions for Protein: B2RR83

Ythdc2, Probable ATP-dependent RNA helicase YTHDC2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc2B2RR83 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ythdc2B2RR83 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ythdc2B2RR83 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms