Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Uhrf1bp1B2KF50 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms