Protein–RNA interactions for Protein: B1B213

H60c, Histocompatibility antigen 60c, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H60cB1B213 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
H60cB1B213 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
H60cB1B213 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
H60cB1B213 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms