Protein–RNA interactions for Protein: B1AYL1

Scn7a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn7aB1AYL1 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Scn7aB1AYL1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Scn7aB1AYL1 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms