Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Nipsnap3aB1AWZ3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms