Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Scml2B1AVB3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Scml2B1AVB3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms