Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trabd2bB1ATG9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trabd2bB1ATG9 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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