Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4930435E12RikA6X8Z9 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
4930435E12RikA6X8Z9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms