Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Ccdc9bA3KGF9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Ccdc9bA3KGF9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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