Protein–RNA interactions for Protein: A2RSY6

Trmt1l, TRMT1-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt1lA2RSY6 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Trmt1lA2RSY6 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Trmt1lA2RSY6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms