Protein–RNA interactions for Protein: A2ARM1

Patl2, Protein PAT1 homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl2A2ARM1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Patl2A2ARM1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms