Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tubb1A2AQ07 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Tubb1A2AQ07 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms