Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syndig1A2ANU3 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms