Protein–RNA interactions for Protein: A2AMM0

Cavin4, Caveolae-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cavin4A2AMM0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cavin4A2AMM0 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Cavin4A2AMM0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms