Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SetxA2AKX3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SetxA2AKX3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms