Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
FocadA2AKG8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
FocadA2AKG8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms