Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Frmpd4A2AFR3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Frmpd4A2AFR3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms