Protein–RNA interactions for Protein: A2A935

Prdm16, PR domain zinc finger protein 16, mousemouse

Predictions only

Length 1,275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm16A2A935 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Prdm16A2A935 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Prdm16A2A935 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Prdm16A2A935 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
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