Protein–RNA interactions for Protein: A2A8L5

Ptprf, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, mousemouse

Predictions only

Length 1,898 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprfA2A8L5 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PtprfA2A8L5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PtprfA2A8L5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms