Protein–RNA interactions for Protein: A2A7B5

Prdm2, PR domain-containing 2, with ZNF domain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm2A2A7B5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prdm2A2A7B5 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prdm2A2A7B5 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms