Protein–RNA interactions for Protein: A0JLY1

Ccdc173, Coiled-coil domain-containing protein 173, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc173A0JLY1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Ccdc173A0JLY1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Ccdc173A0JLY1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms