Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms