Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SWI3

D6Ertd527e, DNA segment, Chr 6, ERATO Doi 527,-expressed, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.31□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
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D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
D6Ertd527eA0A0N4SWI3 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
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