Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Trbv21A0A0A6YX06 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv21A0A0A6YX06 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Trbv21A0A0A6YX06 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Trbv21A0A0A6YX06 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv21A0A0A6YX06 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv21A0A0A6YX06 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trbv21A0A0A6YX06 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Trbv21A0A0A6YX06 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trbv21A0A0A6YX06 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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Trbv21A0A0A6YX06 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Trbv21A0A0A6YX06 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Trbv21A0A0A6YX06 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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Trbv21A0A0A6YX06 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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Trbv21A0A0A6YX06 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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Trbv21A0A0A6YX06 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
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Trbv21A0A0A6YX06 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Trbv21A0A0A6YX06 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
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