Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Gnpnat1-206ENSMUST00000227468 1490 ntAPPRIS P1 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Zfp457-201ENSMUST00000049705 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Dclk1-202ENSMUST00000070418 7012 ntTSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Fhl4-201ENSMUST00000059383 3402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Rsrc2-201ENSMUST00000050827 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Cyp2c69-201ENSMUST00000168838 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 C230038L03Rik-201ENSMUST00000129409 2632 ntTSL 2 BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Nlrp1c-ps-201ENSMUST00000171546 3457 ntTSL 1 (best) BASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Gm43285-201ENSMUST00000196563 3592 ntBASIC7.28□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.24
Lgr5Q9Z1P4 Zfp719-201ENSMUST00000058104 4494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm20750-201ENSMUST00000194274 3515 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 4930533I22Rik-201ENSMUST00000176290 2564 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Nlrc3-204ENSMUST00000180200 3842 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Arl5b-201ENSMUST00000017562 6933 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 CT009696.4-202ENSMUST00000213560 2248 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Zmat4-201ENSMUST00000042352 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm34294-201ENSMUST00000191912 4263 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Zranb2-202ENSMUST00000106057 2737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1278-205ENSMUST00000215210 6901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Trp63-202ENSMUST00000065523 5257 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm14308-202ENSMUST00000117267 777 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm13890-201ENSMUST00000117578 390 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm14574-201ENSMUST00000120644 279 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm14808-201ENSMUST00000129259 361 ntTSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm25559-201ENSMUST00000157182 74 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r-ps84-201ENSMUST00000172853 923 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm27679-201ENSMUST00000184612 84 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm27409-201ENSMUST00000184727 80 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm37837-201ENSMUST00000191743 604 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm37889-201ENSMUST00000194174 251 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm8458-201ENSMUST00000196658 819 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Igkv3-8-201ENSMUST00000197635 339 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 1700065L07Rik-201ENSMUST00000204961 614 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 AC154583.1-201ENSMUST00000224788 655 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 AC102575.1-201ENSMUST00000225348 547 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 AC154283.1-201ENSMUST00000228417 389 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fam229b-201ENSMUST00000063204 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Dynlrb2-201ENSMUST00000078170 515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm16415-201ENSMUST00000080097 489 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm12258-202ENSMUST00000139337 4100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr131-202ENSMUST00000172933 1358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fbxo3-204ENSMUST00000111136 4211 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm14305-203ENSMUST00000108983 1497 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm2026-202ENSMUST00000109008 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm4724-202ENSMUST00000109046 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm4631-201ENSMUST00000109050 1494 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm14434-203ENSMUST00000122097 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm11007-202ENSMUST00000178120 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm2007-202ENSMUST00000178133 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm11007-203ENSMUST00000185834 1494 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm2007-203ENSMUST00000189494 1494 ntTSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Tcp11x2-201ENSMUST00000078605 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Dzank1-204ENSMUST00000163701 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr1505-203ENSMUST00000216835 3685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 C130075A20Rik-201ENSMUST00000198178 4176 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm5084-202ENSMUST00000224064 3609 ntBASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm13219-203ENSMUST00000154223 1843 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Rfx3-201ENSMUST00000046898 4274 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 9530026P05Rik-202ENSMUST00000181145 2968 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Dock2-201ENSMUST00000093193 6409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm44275-201ENSMUST00000203442 2519 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Bnip3l-202ENSMUST00000111115 3259 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Vmn1r-ps97-201ENSMUST00000118338 603 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm13866-201ENSMUST00000118901 968 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Nectin3-204ENSMUST00000119941 529 ntTSL 3 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm8545-201ENSMUST00000120692 801 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Rhox11-ps1-201ENSMUST00000121945 387 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Vmn2r-ps54-202ENSMUST00000150147 2952 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm23250-201ENSMUST00000157444 267 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Fth-ps2-201ENSMUST00000168364 516 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Vmn2r-ps4-201ENSMUST00000176989 1015 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm27266-201ENSMUST00000184521 123 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Scgb1b34-ps-201ENSMUST00000187959 331 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm37577-203ENSMUST00000194712 991 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43237-201ENSMUST00000196835 1044 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm42999-201ENSMUST00000198049 786 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43018-201ENSMUST00000198075 1275 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm36017-201ENSMUST00000199005 923 ntTSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm44219-201ENSMUST00000203005 273 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm44989-201ENSMUST00000204749 217 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr485-201ENSMUST00000208296 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm7624-201ENSMUST00000209702 435 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Sult2a7-203ENSMUST00000210034 870 ntTSL 5 BASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 AL603745.1-201ENSMUST00000215473 532 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Olfr936-202ENSMUST00000216912 937 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 Gm9202-201ENSMUST00000223036 437 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Lgr5Q9Z1P4 AC158525.1-201ENSMUST00000223806 576 ntBASIC7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms