Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS2

Rnf4, E3 ubiquitin-protein ligase RNF4, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf4Q9QZS2 AC167250.1-202ENSMUST00000213629 672 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1065-202ENSMUST00000216162 2148 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr228-201ENSMUST00000216534 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 CAAA01052029.1-201ENSMUST00000218410 271 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC142227.2-201ENSMUST00000220675 400 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 1700111E14Rik-201ENSMUST00000031863 908 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr871-201ENSMUST00000073122 1147 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1505-201ENSMUST00000081520 1103 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr206-201ENSMUST00000084791 1005 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr487-202ENSMUST00000216489 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr50-202ENSMUST00000216753 4531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r185-205ENSMUST00000227461 5318 ntAPPRIS P1 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r43-201ENSMUST00000066317 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr826-202ENSMUST00000203720 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm21854-202ENSMUST00000190391 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr495-201ENSMUST00000210990 1440 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Rbm44-201ENSMUST00000094698 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Cdh12-201ENSMUST00000075132 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC131329.1-201ENSMUST00000221204 3487 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1428-202ENSMUST00000208391 1368 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Ear1-201ENSMUST00000100691 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Traj16-201ENSMUST00000103725 61 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14786-201ENSMUST00000117127 944 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm13013-201ENSMUST00000119087 523 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14520-201ENSMUST00000119258 387 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm13924-201ENSMUST00000119899 486 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm14601-201ENSMUST00000120892 236 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm15388-201ENSMUST00000121578 726 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Crem-222ENSMUST00000144496 978 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm23587-201ENSMUST00000157658 84 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26086-201ENSMUST00000157902 263 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm24216-201ENSMUST00000158259 117 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm23855-201ENSMUST00000158377 135 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm24002-201ENSMUST00000158456 104 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm17268-201ENSMUST00000171515 66 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Lockd-204ENSMUST00000184991 243 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28943-201ENSMUST00000186187 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28736-201ENSMUST00000186257 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29401-201ENSMUST00000186690 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29178-204ENSMUST00000186784 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28589-201ENSMUST00000186991 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28936-201ENSMUST00000187153 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29121-201ENSMUST00000187611 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28243-201ENSMUST00000187801 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28844-202ENSMUST00000187977 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Mrgprb13-201ENSMUST00000188191 985 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29058-201ENSMUST00000189510 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28692-202ENSMUST00000189645 621 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29624-201ENSMUST00000190018 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28780-201ENSMUST00000190223 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28969-211ENSMUST00000190992 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28990-207ENSMUST00000191219 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm17953-201ENSMUST00000192061 667 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm36468-201ENSMUST00000192119 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm36983-201ENSMUST00000192280 1102 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm38150-201ENSMUST00000192996 452 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm31572-201ENSMUST00000193341 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm30175-201ENSMUST00000194173 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm30858-201ENSMUST00000195516 615 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Igkv4-56-201ENSMUST00000198436 349 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Oaz3-204ENSMUST00000199678 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm45171-201ENSMUST00000206360 736 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Ankrd42-207ENSMUST00000207131 1220 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm33601-201ENSMUST00000210001 961 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm8748-201ENSMUST00000211125 587 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm33242-201ENSMUST00000212130 1057 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr856-ps1-201ENSMUST00000212177 948 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 RMST_1.1-212ENSMUST00000220192 413 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Diaph3-206ENSMUST00000226745 713 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 AC130547.1-201ENSMUST00000228079 1047 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr1023-201ENSMUST00000056408 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr190-201ENSMUST00000071243 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Olfr493-201ENSMUST00000080106 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Vmn1r216-201ENSMUST00000080253 1059 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 n-R5s167-201ENSMUST00000083227 121 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm11808-201ENSMUST00000089430 504 ntAPPRIS P1 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm5591-201ENSMUST00000079759 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm44235-201ENSMUST00000204312 3058 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Rnf4Q9QZS2 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.6 ms