Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Gm25179-201ENSMUST00000122632 128 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm13174-201ENSMUST00000126141 220 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm22859-201ENSMUST00000174978 122 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm27039-201ENSMUST00000182438 962 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm27551-201ENSMUST00000184258 77 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm18864-201ENSMUST00000194518 1051 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Olfr303-205ENSMUST00000216409 4106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Ormdl2-202ENSMUST00000217685 666 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 AC123064.1-201ENSMUST00000218950 406 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 AC154450.1-201ENSMUST00000220911 485 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Vmn1r197-203ENSMUST00000227017 5158 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gramd1c-201ENSMUST00000036174 3501 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Cr2-201ENSMUST00000043104 1044 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm24706-201ENSMUST00000082806 137 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Olfr1123-203ENSMUST00000216208 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Vmn1r14-203ENSMUST00000227574 7394 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 9430018G01Rik-201ENSMUST00000203260 3758 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 AC139218.1-201ENSMUST00000228215 4287 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm15638-201ENSMUST00000128159 2062 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Vmn1r171-208ENSMUST00000227866 2566 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Vmn2r39-201ENSMUST00000174388 3577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Tdo2-201ENSMUST00000029645 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm7988-201ENSMUST00000196623 2297 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 3110080E11Rik-201ENSMUST00000210736 3477 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm37412-201ENSMUST00000194866 4321 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Elavl2-202ENSMUST00000102799 3840 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Slamf7-201ENSMUST00000111276 1082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm15670-201ENSMUST00000117740 447 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm14434-201ENSMUST00000120521 559 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Olfr1274-ps-201ENSMUST00000120681 1035 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm12752-201ENSMUST00000121657 811 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm11861-201ENSMUST00000141571 382 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 I0C0044D17Rik-202ENSMUST00000168045 510 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps77-201ENSMUST00000174184 921 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Vmn1r-ps75-201ENSMUST00000174316 920 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm16456-201ENSMUST00000174431 920 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Mir7056-201ENSMUST00000183776 59 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Obox8-201ENSMUST00000184356 1167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm28103-201ENSMUST00000188392 416 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Faiml-202ENSMUST00000188555 560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm28137-201ENSMUST00000191478 416 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm9442-201ENSMUST00000194242 319 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm43408-201ENSMUST00000198263 440 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm43685-201ENSMUST00000198876 706 ntTSL 3 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 1110060G06Rik-201ENSMUST00000200372 499 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm3148-201ENSMUST00000203594 612 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm45690-201ENSMUST00000210775 246 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 AC122395.1-201ENSMUST00000214666 374 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 AC129323.1-201ENSMUST00000216733 470 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Olfr151-202ENSMUST00000221099 929 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Vmn1r219-203ENSMUST00000227388 7948 ntAPPRIS P1 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 2700089I24Rik-201ENSMUST00000190204 1827 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm38505-201ENSMUST00000174005 1326 ntTSL 5 BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm44248-201ENSMUST00000203079 1549 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Otc-202ENSMUST00000115528 2997 ntTSL 1 (best) BASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm36298-201ENSMUST00000223394 1732 ntBASIC4.92□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Kcnj1-201ENSMUST00000047334 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm21037-201ENSMUST00000209086 2608 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Glcci1-203ENSMUST00000161494 3248 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Trav15n-1-201ENSMUST00000103590 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm25418-201ENSMUST00000104214 129 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Smim8-202ENSMUST00000108131 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm11448-201ENSMUST00000120427 450 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm13584-201ENSMUST00000137134 603 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm12114-201ENSMUST00000147896 656 ntTSL 3 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm23513-201ENSMUST00000158181 133 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Speer4cos-201ENSMUST00000162113 1083 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Skint1-205ENSMUST00000162885 603 ntTSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Lsm5-203ENSMUST00000176595 274 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Trav15d-1-dv6d-1-202ENSMUST00000186370 349 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm18426-201ENSMUST00000191874 973 ntBASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm42952-201ENSMUST00000196393 731 ntTSL 2 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Usp27Q8CEG8 Gm21847-202ENSMUST00000198681 883 ntTSL 5 BASIC4.91□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms