Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Btbd35f27-201ENSMUST00000178143 1943 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 2010308F09Rik-202ENSMUST00000186931 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
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Tsr1Q5SWD9 Olfr1390-202ENSMUST00000215014 2875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Itpr2-201ENSMUST00000053273 8331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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Tsr1Q5SWD9 Cenpw-202ENSMUST00000216853 4143 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tsr1Q5SWD9 Glrx2-204ENSMUST00000129653 3515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
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