Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Slc26a3-201ENSMUST00000001254 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r42-204ENSMUST00000142934 3694 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Kbtbd8-202ENSMUST00000119582 4518 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm24048-201ENSMUST00000102411 106 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Trbv20-201ENSMUST00000103277 335 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm11255-201ENSMUST00000120448 1180 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm14563-201ENSMUST00000120571 354 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm24774-201ENSMUST00000157384 134 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r-ps79-201ENSMUST00000173508 963 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r-ps70-201ENSMUST00000173675 963 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Rab26os-201ENSMUST00000176215 477 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 1700003C15Rik-201ENSMUST00000185360 1224 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm5252-201ENSMUST00000189030 909 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Tsg101-ps-201ENSMUST00000201023 1170 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Snhg1-207ENSMUST00000205909 709 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Ceacam-ps1-202ENSMUST00000206683 630 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm19170-201ENSMUST00000212440 1084 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 CT025552.2-201ENSMUST00000225497 317 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 AC164116.1-201ENSMUST00000225810 622 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Ssxb1-201ENSMUST00000037297 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Ear6-201ENSMUST00000074477 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm23875-201ENSMUST00000083711 318 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 n-R5s168-201ENSMUST00000083948 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm45762-201ENSMUST00000212863 2619 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Stk3-205ENSMUST00000226555 2730 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm42704-201ENSMUST00000196875 1778 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r35-205ENSMUST00000227961 1789 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 AC144772.1-201ENSMUST00000226372 2398 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Vmn2r29-201ENSMUST00000170922 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm3962-201ENSMUST00000173027 2587 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Tead1-202ENSMUST00000069256 9480 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Dnah1-201ENSMUST00000048603 12872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm37370-201ENSMUST00000191996 1410 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm28964-202ENSMUST00000186771 1502 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm29301-202ENSMUST00000189344 1502 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Hyal5-201ENSMUST00000031689 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Samd3-202ENSMUST00000164660 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Samd3-203ENSMUST00000218301 2620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Kcnu1-201ENSMUST00000098858 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Ndst3-203ENSMUST00000132112 4460 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm37726-201ENSMUST00000193246 3886 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Btbd35f1-201ENSMUST00000178070 1955 ntAPPRIS P1 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Serpina1f-203ENSMUST00000118101 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Olfr542-ps1-202ENSMUST00000218525 4039 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm22498-201ENSMUST00000104497 86 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Klrc1-203ENSMUST00000118447 684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm13690-201ENSMUST00000118989 285 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm2165-201ENSMUST00000124609 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm14553-201ENSMUST00000126711 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm2101-204ENSMUST00000137421 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm3669-205ENSMUST00000144018 1118 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm22226-201ENSMUST00000157355 109 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm25427-201ENSMUST00000157605 103 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm17571-201ENSMUST00000167906 90 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm4181-201ENSMUST00000170249 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm18828-202ENSMUST00000181035 310 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Ly6c1-203ENSMUST00000185200 540 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm28181-201ENSMUST00000191460 687 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm38991-201ENSMUST00000205504 138 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm44554-201ENSMUST00000208738 147 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 AC125539.1-202ENSMUST00000226449 670 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Anxa13-202ENSMUST00000227274 1201 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Art2b-201ENSMUST00000063920 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Ckap5-201ENSMUST00000046769 6511 ntTSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Cr2-208ENSMUST00000195120 6212 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Herc2-203ENSMUST00000205303 14403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Vps13d-201ENSMUST00000020441 15665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Fam83b-201ENSMUST00000098546 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Mysm1-201ENSMUST00000075872 7420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 2610044O15Rik8-205ENSMUST00000190157 1776 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Zfp874b-201ENSMUST00000019572 3744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm44518-201ENSMUST00000208080 4370 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm13815-201ENSMUST00000119963 412 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm14303-201ENSMUST00000121320 171 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm17025-201ENSMUST00000133273 580 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm12735-201ENSMUST00000146218 651 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm26916-201ENSMUST00000183304 352 ntTSL 5 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm27883-201ENSMUST00000183941 102 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Khdrbs2-202ENSMUST00000185666 543 ntTSL 2 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 4930440C22Rik-202ENSMUST00000190754 512 ntTSL 3 BASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm44474-201ENSMUST00000196525 127 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm42516-201ENSMUST00000198691 767 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm44869-201ENSMUST00000208836 357 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Gm10988-201ENSMUST00000209150 1088 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Klhdc9Q3USL1 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC5.47□□□□□ -1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.5 ms