Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm14554-201ENSMUST00000119548 661 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm12287-201ENSMUST00000119770 707 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm13367-201ENSMUST00000119955 796 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Dnajc19-ps-201ENSMUST00000120890 351 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm14125-202ENSMUST00000120921 756 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm14986-201ENSMUST00000121262 1002 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr1397-ps1-201ENSMUST00000121388 962 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm11909-201ENSMUST00000121424 759 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm14383-201ENSMUST00000121637 386 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm11200-201ENSMUST00000121698 448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm25966-201ENSMUST00000157169 117 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm26312-201ENSMUST00000157769 165 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 B230216N24Rik-204ENSMUST00000161661 719 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Snhg14-202ENSMUST00000185693 734 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm43794-201ENSMUST00000200971 692 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm44134-202ENSMUST00000204777 545 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC123064.2-201ENSMUST00000217758 193 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 2310002D06Rik-201ENSMUST00000218103 508 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC122301.1-201ENSMUST00000219625 507 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 4930448C13Rik-204ENSMUST00000221610 1044 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr273-201ENSMUST00000051520 1059 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr1018-201ENSMUST00000054201 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr1507-201ENSMUST00000073571 1112 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 BC023105-201ENSMUST00000073997 1227 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr1484-201ENSMUST00000074180 948 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr1469-201ENSMUST00000077538 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr1321-201ENSMUST00000088876 1056 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Pola1-201ENSMUST00000006856 5346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Nxt2-201ENSMUST00000042329 2447 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Ptprd-204ENSMUST00000102834 8084 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Zfp995-201ENSMUST00000106026 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm12633-201ENSMUST00000117742 1705 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr693-202ENSMUST00000215541 4015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Ehf-201ENSMUST00000090475 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 CT009504.2-201ENSMUST00000217951 2960 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr357-202ENSMUST00000213218 5367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm37268-201ENSMUST00000192254 2614 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm37677-201ENSMUST00000194520 7634 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm43333-201ENSMUST00000198340 2262 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Anapc10-201ENSMUST00000048147 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm19950-204ENSMUST00000208167 4196 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 D630030B08Rik-201ENSMUST00000202983 3479 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Cbx5-202ENSMUST00000118152 8803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 P2ry14-205ENSMUST00000197220 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm19301-201ENSMUST00000174283 2210 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr312-202ENSMUST00000216407 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr19-202ENSMUST00000206365 1967 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Kmt2d-202ENSMUST00000178486 19805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr344-202ENSMUST00000215879 7675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Clca4c-ps-202ENSMUST00000200595 2779 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Prl2b1-202ENSMUST00000102954 870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm24935-201ENSMUST00000103770 110 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm24235-201ENSMUST00000104319 129 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Hspb11-202ENSMUST00000106749 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm12734-201ENSMUST00000120228 948 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Platr27-201ENSMUST00000131365 629 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm14167-201ENSMUST00000148705 433 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 4930577H14Rik-201ENSMUST00000151367 790 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm13219-202ENSMUST00000152599 685 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm26350-201ENSMUST00000157531 288 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm22084-201ENSMUST00000157585 105 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm16549-201ENSMUST00000160445 503 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm3025-201ENSMUST00000163454 489 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm3077-201ENSMUST00000165903 627 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm2878-201ENSMUST00000170173 486 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm7271-201ENSMUST00000172369 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm19206-201ENSMUST00000186401 827 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm29086-201ENSMUST00000186774 222 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm29085-201ENSMUST00000187108 225 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm28468-201ENSMUST00000188536 615 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm37002-201ENSMUST00000194560 373 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm43967-201ENSMUST00000203787 301 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 1700126G02Rik-201ENSMUST00000204351 725 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm18537-201ENSMUST00000205709 989 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm17987-201ENSMUST00000206902 603 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm10297-201ENSMUST00000207136 651 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm45189-201ENSMUST00000208567 363 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC153870.1-201ENSMUST00000219599 560 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC159622.1-201ENSMUST00000221004 554 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Gm4263-202ENSMUST00000221392 667 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC163721.1-201ENSMUST00000222669 394 ntTSL 3 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC156559.1-201ENSMUST00000224158 222 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC134864.1-201ENSMUST00000226326 511 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 AC151907.1-201ENSMUST00000228812 412 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Olfr469-201ENSMUST00000075704 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.98□□□□□ -1.61
Q3U6N9 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms