Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Entpd1-201ENSMUST00000112231 4221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r171-210ENSMUST00000228484 2421 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm33378-201ENSMUST00000219831 2758 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm7416-201ENSMUST00000117448 1487 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43490-201ENSMUST00000197593 2652 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vps41-201ENSMUST00000072961 3199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Slc6a15-202ENSMUST00000179636 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Lair1-201ENSMUST00000068865 6828 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 4930405D11Rik-201ENSMUST00000132218 568 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15687-201ENSMUST00000141440 269 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm23534-201ENSMUST00000157539 97 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm25048-201ENSMUST00000158598 91 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Lgals1-ps1-201ENSMUST00000173500 368 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Pinc-202ENSMUST00000190487 961 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42454-201ENSMUST00000196805 1181 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Chaer1-201ENSMUST00000201649 651 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43919-201ENSMUST00000204303 364 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC134333.1-201ENSMUST00000204536 944 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1473-ps1-201ENSMUST00000207135 958 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm44919-201ENSMUST00000208587 1073 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Kcnj1-203ENSMUST00000213393 1277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 CT030030.1-201ENSMUST00000218809 152 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm4263-201ENSMUST00000220693 1101 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm9512-201ENSMUST00000223112 497 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC131745.1-201ENSMUST00000223660 330 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr68-201ENSMUST00000072513 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm23102-201ENSMUST00000083724 116 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1218-201ENSMUST00000099798 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1056-201ENSMUST00000099893 1079 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Btbd35f19-201ENSMUST00000178444 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Btbd35f20-201ENSMUST00000179325 1960 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm43781-201ENSMUST00000197634 2681 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr348-203ENSMUST00000214909 3634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Meis1-206ENSMUST00000144988 7553 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm29098-201ENSMUST00000186104 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28130-201ENSMUST00000186321 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28089-202ENSMUST00000187266 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm29204-202ENSMUST00000187384 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28753-201ENSMUST00000187804 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28518-203ENSMUST00000188788 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28488-203ENSMUST00000188792 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm29131-202ENSMUST00000189485 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28284-202ENSMUST00000190221 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28764-203ENSMUST00000191194 1498 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm45183-201ENSMUST00000207937 1497 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Clec2g-203ENSMUST00000142388 2404 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 3222401L13Rik-202ENSMUST00000192137 6292 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm28183-201ENSMUST00000191321 1406 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm11264-201ENSMUST00000143755 2969 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Kdm4c-202ENSMUST00000077851 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Prune2-201ENSMUST00000087689 12512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm42479-201ENSMUST00000198654 1356 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Ncoa7-202ENSMUST00000092610 2590 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1286-203ENSMUST00000213210 3740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1283-202ENSMUST00000204064 1625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Ccdc66-202ENSMUST00000223689 4262 ntAPPRIS P2 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37890-201ENSMUST00000195610 3992 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Scn9a-207ENSMUST00000169900 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Ermn-201ENSMUST00000090940 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Traj17-201ENSMUST00000103724 63 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm22543-201ENSMUST00000104347 94 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm8660-201ENSMUST00000105187 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm4177-201ENSMUST00000105196 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r127-201ENSMUST00000105199 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm5728-201ENSMUST00000105209 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Macrod2-203ENSMUST00000110061 887 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15161-201ENSMUST00000117340 387 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm9432-201ENSMUST00000117810 759 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm15981-201ENSMUST00000119196 457 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Olfr1050-ps1-201ENSMUST00000119802 947 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Prdx6-ps2-201ENSMUST00000121989 694 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm5353-201ENSMUST00000139800 793 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm26153-201ENSMUST00000157433 127 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Ear-ps9-201ENSMUST00000161963 460 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r94-201ENSMUST00000164526 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm4216-201ENSMUST00000168926 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r142-201ENSMUST00000169697 918 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm17430-201ENSMUST00000171339 474 ntAPPRIS P1 BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Vmn1r-ps29-201ENSMUST00000174862 785 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Mir6963-201ENSMUST00000183535 71 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm20776-201ENSMUST00000189940 700 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37492-201ENSMUST00000191948 376 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm37708-201ENSMUST00000192337 895 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm5285-201ENSMUST00000193089 666 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
Trim71Q1PSW8 Gm38268-201ENSMUST00000195813 193 ntBASIC5.31□□□□□ -1.56
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